從人和動(dòng)植物的表皮到人和動(dòng)物的內(nèi)臟，也都生活著大量的微生物。如大腸桿菌在大腸中清理消化不完的食物殘?jiān)?，把手放到顯微鏡下觀察,一雙普通的手，上竟有四萬到四十萬個(gè)細(xì)菌，即使是一雙剛剛用清水洗過的手，上面也有近三百個(gè)細(xì)菌。幸好大多數(shù)微生物不是致病菌，否則后果將不堪設(shè)想。

當(dāng)正常菌群與人體處于生態(tài)平衡時(shí)，菌群在它們寄居的人體部位獲取營(yíng)養(yǎng)進(jìn)行生長(zhǎng)繁殖，而宿主也能從這些寄生在他們身上的細(xì)菌中得到多種好處。一般來說，有以下幾方面:

菌群的營(yíng)養(yǎng)作用

正常菌群的營(yíng)養(yǎng)來自宿主組織細(xì)胞的分泌液、脫落細(xì)胞以及某些腔道中的食物碎屑和殘?jiān)?。菌群的代謝產(chǎn)物除供給細(xì)菌自身利用外，一部分可以被宿主吸收利用。例如，過去外科醫(yī)生不太重視腸道正常菌群中的大腸埃希氏菌能合成B族維生素和維生素K的功能，所以在腸道手術(shù)后為避免發(fā)生感染，常用抗生素作預(yù)防性治療，結(jié)果手術(shù)后感染是防止了，病人卻出現(xiàn)了厭食和貧血等維生素B和維生素K的缺乏癥，因?yàn)榇竽c桿菌也被抗生素防術(shù)后感染的同時(shí)，必須補(bǔ)充足量的維生素B和維生素K。

菌群起到的免疫作用

在正常菌群的細(xì)胞中，有許多成分可以促進(jìn)宿主免疫器官的發(fā)育成熟。有學(xué)者曾經(jīng)做過實(shí)驗(yàn)，他們把剛孵化出來的小雞分成兩組，--組放在沒有細(xì)菌的環(huán)境中生活，成為無菌雞;另一組讓它們正常生活，即帶菌雞。結(jié)果發(fā)現(xiàn)無菌雞的小腸和回育部的淋巴結(jié)都要比普通帶菌雞少80%左右。如果將這些無菌雞暴露在普通有菌的環(huán)境中飼養(yǎng)，使之建立正常菌群，則經(jīng)2周后，它們免疫器官的發(fā)育和功能就可與普通雞相近。此外，有些正常菌群的細(xì)胞組分與病原菌的相同，因此，它們能刺激宿主免疫系統(tǒng)產(chǎn)生像抗體一類的免疫物質(zhì),這些免疫物質(zhì)也能對(duì)抗相應(yīng)病原菌的侵襲。

抗衰老作用

現(xiàn)在一般認(rèn)為，衰老是由于體內(nèi)積累了過多的有毒化學(xué)物質(zhì)----自由基。雙歧桿菌、乳桿菌、腸球菌等腸道正常菌群產(chǎn)生的超氧化物歧化酶，可以催化宿主體內(nèi)自由基的歧化反應(yīng)，消除自由基毒性，保護(hù)細(xì)胞免受活性氧的損傷，因此具有一定的抗衰老作用。

其他作用

腸道正常菌群有一定的抗腫瘤作用。其原因是這些正常菌群能產(chǎn)生多種酶，以降解腸道內(nèi)致癌物，或可以將致癌物的物質(zhì)轉(zhuǎn)變成為無害物質(zhì)。它們還可以激發(fā)人的免疫功能，調(diào)動(dòng)處于待命狀態(tài)的巨噬細(xì)胞等人體衛(wèi)士圍殲病原菌。